Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD2P0DJD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD2P0DJD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms