Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTAP09496 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTAP09496 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTAP09496 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTAP09496 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTAP09496 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTAP09496 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTAP09496 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTAP09496 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTAP09496 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTAP09496 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTAP09496 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTAP09496 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTAP09496 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTAP09496 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTAP09496 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTAP09496 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTAP09496 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTAP09496 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTAP09496 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTAP09496 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTAP09496 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTAP09496 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTAP09496 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTAP09496 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTAP09496 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms