Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM1P09493 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM1P09493 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM1P09493 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM1P09493 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM1P09493 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM1P09493 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM1P09493 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM1P09493 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM1P09493 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM1P09493 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM1P09493 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM1P09493 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM1P09493 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM1P09493 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM1P09493 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM1P09493 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM1P09493 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM1P09493 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM1P09493 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM1P09493 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM1P09493 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM1P09493 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM1P09493 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM1P09493 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM1P09493 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms