Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP1P09455 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP1P09455 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP1P09455 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP1P09455 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP1P09455 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP1P09455 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP1P09455 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP1P09455 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP1P09455 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP1P09455 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms