Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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