Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPSAP08865 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPSAP08865 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPSAP08865 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPSAP08865 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPSAP08865 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPSAP08865 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPSAP08865 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPSAP08865 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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