Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRCP08575 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRCP08575 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRCP08575 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
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