Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HSP90AB1P08238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HSP90AB1P08238 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HSP90AB1P08238 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms