Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPM2P07951 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPM2P07951 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPM2P07951 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPM2P07951 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPM2P07951 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TPM2P07951 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPM2P07951 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM2P07951 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM2P07951 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM2P07951 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM2P07951 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPM2P07951 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPM2P07951 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPM2P07951 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM2P07951 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM2P07951 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM2P07951 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM2P07951 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPM2P07951 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms