Protein–RNA interactions for Protein: P07738

BPGM, Bisphosphoglycerate mutase, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPGMP07738 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BPGMP07738 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPGMP07738 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPGMP07738 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPGMP07738 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPGMP07738 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPGMP07738 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPGMP07738 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPGMP07738 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BPGMP07738 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPGMP07738 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPGMP07738 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPGMP07738 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPGMP07738 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPGMP07738 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPGMP07738 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPGMP07738 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPGMP07738 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPGMP07738 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPGMP07738 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPGMP07738 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms