Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALB1P05937 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALB1P05937 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALB1P05937 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALB1P05937 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALB1P05937 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALB1P05937 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALB1P05937 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALB1P05937 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALB1P05937 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALB1P05937 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALB1P05937 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALB1P05937 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms