Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYBBP04839 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYBBP04839 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYBBP04839 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYBBP04839 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYBBP04839 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYBBP04839 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYBBP04839 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYBBP04839 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYBBP04839 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYBBP04839 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYBBP04839 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYBBP04839 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYBBP04839 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CYBBP04839 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYBBP04839 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYBBP04839 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms