Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV3-11P04433 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV3-11P04433 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms