Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A1P02730 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A1P02730 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms