Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC2P02655 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC2P02655 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC2P02655 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC2P02655 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOC2P02655 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOC2P02655 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOC2P02655 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC2P02655 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC2P02655 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC2P02655 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC2P02655 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC2P02655 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC2P02655 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC2P02655 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC2P02655 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC2P02655 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC2P02655 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC2P02655 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC2P02655 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC2P02655 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC2P02655 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms