Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC1P02654 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC1P02654 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC1P02654 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOC1P02654 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC1P02654 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC1P02654 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC1P02654 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC1P02654 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC1P02654 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms