Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC1P01850 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBC1P01850 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms