Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKCP01834 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKCP01834 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKCP01834 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKCP01834 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKCP01834 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKCP01834 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKCP01834 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKCP01834 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKCP01834 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKCP01834 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKCP01834 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKCP01834 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKCP01834 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKCP01834 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKCP01834 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKCP01834 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms