Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTCP00480 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTCP00480 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTCP00480 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTCP00480 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTCP00480 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTCP00480 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTCP00480 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTCP00480 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTCP00480 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTCP00480 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTCP00480 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTCP00480 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTCP00480 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTCP00480 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTCP00480 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTCP00480 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTCP00480 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OTCP00480 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTCP00480 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms