Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4FO95754 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms