Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE6O95741 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE6O95741 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms