Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRTAMO95727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms