Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP29O95721 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms