Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNTO95613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNTO95613 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNTO95613 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNTO95613 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNTO95613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNTO95613 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNTO95613 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNTO95613 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNTO95613 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNTO95613 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNTO95613 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNTO95613 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNTO95613 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCNTO95613 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCNTO95613 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCNTO95613 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCNTO95613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCNTO95613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCNTO95613 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNTO95613 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNTO95613 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNTO95613 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCNTO95613 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms