Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1O95273 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1O95273 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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