Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATE1O95260 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATE1O95260 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATE1O95260 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATE1O95260 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATE1O95260 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATE1O95260 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATE1O95260 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATE1O95260 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATE1O95260 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATE1O95260 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATE1O95260 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATE1O95260 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATE1O95260 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATE1O95260 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATE1O95260 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms