Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCELO95171 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCELO95171 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCELO95171 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCELO95171 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCELO95171 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCELO95171 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCELO95171 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCELO95171 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCELO95171 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCELO95171 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCELO95171 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCELO95171 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCELO95171 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms