Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC24DO94855 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24DO94855 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24DO94855 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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