Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SLIT2O94813 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLIT2O94813 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLIT2O94813 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms