Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP72O76094 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP72O76094 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRP72O76094 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRP72O76094 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRP72O76094 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP72O76094 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP72O76094 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP72O76094 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP72O76094 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP72O76094 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms