Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIPRLO75663 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIPRLO75663 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIPRLO75663 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIPRLO75663 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIPRLO75663 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIPRLO75663 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIPRLO75663 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIPRLO75663 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIPRLO75663 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms