Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NPM3O75607 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPM3O75607 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM3O75607 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM3O75607 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPM3O75607 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPM3O75607 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NPM3O75607 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPM3O75607 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM3O75607 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM3O75607 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM3O75607 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM3O75607 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM3O75607 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM3O75607 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM3O75607 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM3O75607 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM3O75607 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM3O75607 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM3O75607 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM3O75607 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM3O75607 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms