Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMPCBO75439 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMPCBO75439 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms