Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB11FIP3O75154 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP3O75154 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms