Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF2O60811 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRAMEF2O60811 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms