Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX2O60749 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX2O60749 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX2O60749 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX2O60749 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX2O60749 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX2O60749 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX2O60749 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX2O60749 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX2O60749 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX2O60749 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX2O60749 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX2O60749 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX2O60749 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX2O60749 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX2O60749 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX2O60749 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX2O60749 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX2O60749 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms