Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA3O60609 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms