Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKAB2O43741 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms