Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN4O43707 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN4O43707 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN4O43707 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms