Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms