Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2LO15068 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCF2LO15068 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms