Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SYNJ2O15056 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SYNJ2O15056 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SYNJ2O15056 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYNJ2O15056 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms