Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFXANKO14593 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms