Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPEO14579 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPEO14579 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPEO14579 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPEO14579 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPEO14579 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPEO14579 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPEO14579 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPEO14579 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPEO14579 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPEO14579 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPEO14579 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPEO14579 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPEO14579 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPEO14579 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPEO14579 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms