Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOCS6O14544 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOCS6O14544 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS6O14544 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS6O14544 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS6O14544 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOCS6O14544 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOCS6O14544 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms