Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE40O14503 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms