Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL22O00626 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL22O00626 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL22O00626 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL22O00626 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL22O00626 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL22O00626 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL22O00626 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL22O00626 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL22O00626 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL22O00626 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCL22O00626 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL22O00626 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL22O00626 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL22O00626 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms