Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBAG9O00559 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms