Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS1O00470 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS1O00470 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms