Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4O00268 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF4O00268 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF4O00268 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF4O00268 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF4O00268 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF4O00268 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms